ナノポア シーケンサー
1 ナノポアシークエンサーの登場 「次世代シークエンサー」という言葉はもはや使いたくない. 超並列シークエンサー商品化の先鞭をつけた454社は,2005年の発売開始から2016年の販売後サポート終了までの「世代」を全うしたし,illumina社もその技術基盤をもつSolexa社買収からすでに10年が経過
Nanoporeシーケンサー は、DNAを一分子ずつ小さな穴(nanopore)を通し、AGCTの塩基が通る際の電流変化の違いを利用してDNAの塩基配列を解読しようとする、次次世代(? )のシーケンサーです。 DNAを断片化して大規模並列に解読する、いわゆる「次世代シーケンサー」に比べると、配列解読の方法はとても直感的でわかりやすい。 いよいよDNAを一本ずつ読む夢に見た時代が到来した、という感じでしょうか。 さらには、Nanoporeシーケンサーの中でも現在最も小さなMinIONは、USBでPCにつながる「お手元シーケンサー」であるという驚くべき特徴もあります。 初めにその話を聞いたことがある人は、「そんなデバイスで本当にシーケンスができるのか?
ナノポアシーケンサーは、従来の次世代シーケンサーよりもロングリードのDNA解析が可能である点が特長。. ・MinKNOWとは. ナノポアシーケンサー「MinION」でシーケンスを行うための専用ソフト。. MinION自体はUSBで直接PCにつなげるタイプのシーケンサーで
GridION. ・本体内部にシーケンサーコントロールソフト、. ベースコールソフトがインストール済みのPC一体型. ・高精度でのベースコール(1リード当たり98%≦)が. シーケンスと同時に実施可能なGPUを搭載. (リアルタイム・ベースコール機能). ・Adaptive
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