ナノポア シーケンサー 原理
図2 4世代目のシークエンサーの代表的な原理 (A)シークエンサーデバイスの構造.(B)バイオナノポアを用いた塩基識別の原理.脂質二重膜を挟んで設置された電極間を流れるイオン電流の変化が,4つの塩基分子で異なる.(C)ナノギャップナノポアを用いた塩基識別の原理.ナノ電極間を流れるトンネル電流が,ナノ電極間に存在する1塩基分子の僅かな電子状態(電気抵抗)の違いを読み出す.4つの塩基分子の電気抵抗が異なるため,4つの塩基分子は,トンネル電流により識別される.
All Oxford Nanopore sequencing devices rely on flow cells for sequencing to take place — this is where the nanopores are housed. MinION flow cells are compatible with MinION, our pocket-sized portable sequencer, and GridION, our compact desktop sequencer. With a theoretical output of 50 Gb per MinION flow cell, GridION, which holds up to 5 MinION Flow Cells can generate up to 250 Gb of data.次世代シーケンス技術の歴史と共に,現行主力機種 (図3 )の原理や性能について紹介した.NGSの能力は産出するデータ量や解読できるリード長が主な特徴になるが,データ量に関してはNovaSeq やT7が突出しており,リード長に関してはNanoporeであれば調製する長鎖DNA次第でさらに解読長を伸ばせる可能性がある.す 図3.現行の主力機種.左からNovaSeq6000,Flongle,MinION,PromethION,DNBSEQ-G400,DNBSEQ-T7,PacBio-Sequel II.
ナノポアによる塩基識別ができることが明らかになったのはこれが初めてであり、由来のわからないdna鎖の塩基配列を決定できるナノポア技術の実現への重要な一歩である。 塩基配列の解読にナノポアを利用するという案が出されたのは20年以上前だが
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